मानव संसाधन विकास मंत्रालय ने राष्ट्रीय बाल स्वास्थ्य कार्यक्रम के प्रभावी कार्यान्वयन के लिए राष्ट्रीय ग्रामीण स्वास्थ्य मिशन के साथ समन्वय के उद्देश्य से सभी राज्यों के शिक्षा विभागों को लिखा है। राष्ट्रीय बाल स्वास्थ्य कार्यक्रम केंद्र सरकार की नई पहल है जिसका उद्देश्य जन्म से 18 वर्ष की आयु के बच्चों की जांच और प्रबंध करना है। इसके तहत जन्म के समय त्रुटियों, कमियों, बीमारियों, बच्चे के विकास में देरी सहित विकलांगता का प्रबंध करना भी शामिल है।
वर्तमान वित्त वर्ष 2013-14 के दौरान स्कूली बच्चों सहित कुल 3 करोड़ 45 लाख बच्चों की इस योजना के तहत जांच की गई। स्वास्थ्य समस्या वाले करीब 12 लाख बच्चों की पहचान की गई तथा स्वास्थ्य केंद्र रैफर किए गए।
राज्यों के दौरे के दौरान मध्याह्न भोजन योजना के लिए संयुक्त समीक्षा मिशनों ने राष्ट्रीय बाल स्वास्थ्य कार्यक्रम के कार्यान्वयन की समीक्षा की है। स्वास्थ्य एवं परिवार कल्याण मंत्रालय के प्रतिनिधि इस संबंध में समुचित समन्वय सुनिश्चित करने के लिए मध्याह्न भोजन योजना की संरचना में संलग्न है।